Da das Hyrule Historia von Nintendo herausgegeben wurde, habe ich mal darin gelesen. Also der Anfang ist ja in Skyward Sword, wo das Schwert in einen Sockel gesteckt wird. Auf Seite 77 der deutschen Version wird Raurus Einsatz beschrieben. Die Leute gierten in der Ära des Chaos nach der Macht des Triforce und so ließ er die Zitadelle der Zeit errichten. Das war nach Skyward Sword und bis jetzt vor allem anderen. Doch ist nicht die Rede von EINEM Sockel sondern von DEM Sockel. Schon möglich, dass es ein anderer Ort ist, aber so wie das klang, hörte es sich nach "Altes Gebäude verfallen und neues hingepflanzt" an. Rauru muss übernaürlich alt werden können oder zumindest meist an einem Ort existieren, wo die Zeit anders fließt, denn er taucht erst wieder in der Ära des Helden der Zeit wieder auf, also zu Ocarina of time. Als einer der Weisen ist ihm das wohl möglich.
Es folgt die Ära des Lichts und des Schattens (A link to the past Seite 96). Dazu steht hier, dass das Schwert, welches nun im verlorenen Wald ruht, ursprünglich in einem Tempel aufbewahrt wurde. Dieser ist jedoch verfallen. Da wird nochmal deutlich, wieviel Zeit hier zwischen liegt.
In einer anderen Zeitlinie (laut Nintendo gibt es ja drei) kommt es irgendwann zur Ära der Dämmerung (Twilight princess). Auch hier ist das Schwert in einem Sockel im Wald, aber mehr steht dazu auch nicht geschrieben (Seite 115).
Insgesamt sagen sie also nie dass es wirklich der selbe Tempel und der selbe Sockel ist. Ich tendiere zu, es ist nicht immer der selbe Tempel oder aber es ist der Erdverschiebung oder des Umzugs einer Stadt geschuldet, dass das Schwert sich nicht mehr in jener Stadt befindet wie in Oot.